最先执行这项任务的是“海狼”号潜艇，它先送37吨弹药。后送25名陆海军飞行员、“卡诺珀斯”号潜艇供应舰上的一分重要潜艇备品和16条鱼雷。

这时，德国潜艇已经开始采用夜间上攻击的战术。但是，国海军仍把潜望镜度的昼间攻击作为潜艇的基本战术。为使空中侦察难以发现，国潜艇的艇壳上涂黑迷彩，这对夜间在面活动的潜艇起不到多少伪装作用。

这支潜艇队除继续行巡逻外，还须担任撤退任务和补给任务。这就是说，潜艇必须协助有关单位把平民百姓和重要军事人员转移到其他地方，从被围困的丹半岛和哥黎希律岛撤某些财，以及为逐渐减少的守备队运送粮、医药和弹药等补给品。

在爪哇海作战期间，潜艇虽未取得什么战果，但军已着手建立潜艇巡逻区，并开始改潜艇战术。

潜艇队的袭击活动很不顺利。潜艇虽然占领了有利的鱼雷发阵位，但是发的鱼雷不是未命中目标，就是过早爆炸。这说明国海军的鱼雷在设计方面存在严重缺陷，因而没有击毁日本的运输船只，未达到迟滞日军行动的目的。

在此期间，正在甲米地修理的“海狮”号潜艇，在日军的首次空袭中就被击毁。这是国战时损失的52艘潜艇中的第一艘。当时。在亚洲海区，日军战斗舰艇的数量占压倒的优势。

12月21日，日军登陆队为攻占尼拉而在仁牙因湾登陆。当时，潜艇因备品不足。没有一艘能够参加保卫仁牙因湾的战斗。日登陆队在严密的警戒下，于仁牙因湾内巧妙地利用浅滩域和暗礁等天然条件，阻止潜艇对它行袭扰。

最初的潜望镜不能准确地测目标距离，而声纳只能提供目标的方位。因此，潜艇艇长实施鱼雷攻击时往往忽视距离这个因素。不久，潜望镜上安装了测距装置。

好的战斗能。

有了能良好并适于夜间使用的潜望镜，潜艇就容易在潜望度实施夜间攻击了。可是，国潜艇直到有了较准确的鱼雷击自动计算

只有s-38号潜艇大胆地突破其警戒线，击沉1艘即将锚地的运输船。“海豹”号潜艇对一艘开往登陆地域的小型货船行了鱼雷攻击。

二十世纪41年建造的“小鲨鱼”号潜艇就是这类型的，上排量1500吨。长95米，作战半径1200海里，艇艏鱼雷发6个，艇尾鱼雷发4个，可携带鱼雷24条，甲板上装有80毫米火炮1门和机枪4。艇上有8名军官和80名士兵。这就是军用来同日军作战的基本类型的潜艇。

因此，对盟军舰队来说，每艘战斗舰艇都是非常宝贵的。在“威尔土亲王”号和“反击”号被击沉后，远东盟军面舰艇队中最大的军舰就剩下一艘重巡洋舰了。

潜艇艇长还知，偶然用一下声纳测定距离，还不至于暴自己的位置。能够准确测定目标的距离后，国潜艇就可以实施较有把握的鱼雷攻击了。

由于日军对尼拉附近基地的威胁日益增大，盟国海军队主动撤离。约翰威尔克斯海军上校指挥的亚洲舰队潜艇队，首先撤至达尔文港，后来又转移到弗里曼特尔在澳大利亚西南海岸。只把“卡诺珀斯”号潜艇供应舰留在尼拉湾。以保障潜艇继续作战。

初期，潜艇通常在潜望度实施昼间攻击。为了不被对方发现，只伸潜望镜作短暂的观测。采用这攻击方法时，只使用噪音测向材而不使用回音声材。以免暴自己的位置。

盟军的潜艇队虽然行了抗击，但是战果甚微。12月，军有28艘潜艇对日军驶往菲律宾的登陆输送队先后行31次袭击，发66条鱼雷，仅仅击沉日本舰只2艘。

一开战就投战斗的国潜艇的任务是支援菲律宾的抗登陆作战。这些潜艇奉命一边侦察日军的防潜警戒和反潜手段，一边把防线谨慎地向前推。在吕宋岛周围建立起一防线。置若潜艇，以监视和截击敌人。

加之没有夜间使用的能良好的潜望镜，天黑后，潜艇就难以在潜望度实施攻击。后来的经验证明，艇的两舷涂上灰的亮漆。对夜间行动有很好的伪装效果。