虽然昆仑山河接纳一些雨，但其主要由积雪和冰川供，量遂因季而异，百分之六十到百分之八十的量现于夏季月份。

主要河有塔里木盆地中的车尔臣河，柴达木盆地的有那仁郭勒河、乌图仁河、及柴达木河，前者由冰雪补给，属于塔里木内系，后四者由降与湖补给，属于柴达木内系。

位沼泽化草甸，米旱冰碛丘陵与冰冲积扇分布着雌雄麻黄为主的木荒漠，谷地两侧四千米以上为以粉蒿和垫状驼绒藜占优势的寒荒漠，四千五百到五千五百米的山为刺矶松、寒棘豆寒半木荒漠，海五千五百到六千五百米的山下为寒稀疏植被，上为寒冻风化带，六千五百米以上为山冰雪带。

在帕米尔和西藏诸山附近，年降量增加到四百五十七公厘，在山（与北平原界的山）的低层，七月平均气温是二十五到二十八度，在一月不低于零下九度。

这时冰雪的烈化与最大降结合在一起，雪和冰川的烈蒸发导致浅盐湖的形成。该山尽海很，却由于气候极端燥而几乎没有冰川作用，外表积雪只存在于最山峰的隙之中，冰川活动的主要中心现在海约接近七千公尺之，所有冰川都以其非同寻常的陡峭和缺乏而引人注目，该山几乎完全不受印度洋和太平洋季风的气候影响，相反其却于大陆气团的持续影响之下，引起年气温和日气温的大波动，山系中段最燥。

东昆仑山海六千米以上的山峰有四座，五千米以上的山峰有八座，平均海四千五百到五百米，积雪分布在五千八百米以上的山峰，昆仑山垭一带的雪线度，北坡五千两百米，南坡五千四百米，雪线附近的年均温零下九度到零下八度，山间谷地西大滩一带的年均温低于零下三度，年降量三百五十毫米左右，山地年降量略有增加，青藏原北坡现代多年冻土的下界在四千两百米左右。

向东略呈扇形展开，分为三支：北支祁漫塔格山，其南隔以阿牙克库木盆地，东延为唐松乌拉山、布尔汗布达山，中支阿尔格山，东延为博卡雷克塔格、唐格乌拉山与布青山，地形上与阿尼玛卿山相接，南支为构成青南原上的主山脉，东延与相接，昆仑山垭是青藏公路必经之。

位于新藏公路与车尔臣河九个大坂山即东经七十七度到八十六度，主脉向南略呈弧形，克里雅山和喀拉米兰山是该段联系新疆―西藏通，中昆仑山海六千米以上的山峰有八座，如乌孜塔格、慕士山、琼木孜塔格，平均海五千到五千五百米，北坡雪线五千一百到五千八百米，主要河有喀拉喀什河、玉龙喀什河、克里雅河、尼雅河及安迪尔河，除和田河上源喀拉喀什河和玉龙喀什河量较大，有利溉外，其他河山后很快没塔克拉玛沙漠中，山地下为合草、红沙半木荒漠，棕漠土，上为沙生针茅、短针茅为主的草原化荒漠，棕钙土，向上过渡为针茅、昆生葱、昆仑蒿为主的寒荒源草原，在海四千五百米山地内坡麓及岩屑坡上，垫状驼绒藜、糙地梅组成稀疏的寒荒漠，在海四千五百到五千五百米的下为稀疏植被，上为寒冻风化带，更山峰则为冰雪带。

而西和东的气候多少缓和一些。＊＊＊该山最燥的地区，年降量在山麓不足五十公厘，在海区约为一百多公厘。

然而在山的上和西藏边界，七月平均温度低于十度，在冬季则常降至零下三十五度或更低。昆仑山北坡属温带塔里木荒漠和柴达木荒漠，降量小。

昆仑山是中亚仅有内系地区的一个组成分，主要与北面的塔里木盆地和柴达木盆地及南面的西藏原有关，只有黄河与长江源所在的山系最东支脉有注海洋的系，该山有两个主要河网，发源于喀喇昆仑山脉和藏北的大河，切割峡谷，穿越整个昆仑山链而去，还有疏外围山坡的小河，主要河形成漫长曲折的河谷，有几条河给昆仑山北缘绿洲供应溉用。

山地北坡为荒漠化草原，在海三千六百米以下为燥剥蚀的基岩山地，几无植生长，沟坡及岩屑上堆散生有垫状驼绒藜，红沙、合草荒漠，三千六百到三千八百米过渡为紫针茅亚山草原，三千八百到四千五百米的山地下是以小嵩草为主的草原化山草甸，上为垫状植被，四千五百到五千米以上过渡为稀疏的寒植丛和寒冻风化带，五千五百米以上为山冰雪带。